Plateforme Spatial Multi-Omics de l’Institut d’Hépatologie de Lyon

La plateforme Spatial Multi-Omics de l’IHU EVEREST, installée à l’Institut des Sciences Analytiques, représente une avancée majeure dans le domaine de l’analyse multi-échelle/ multi-omics sur les pathologies chroniques du foie. En combinant la protéomique, la métabolomique et la lipidomique sur un même échantillon, elle offre une compréhension approfondie des processus biologiques complexes à l’échelle moléculaire.
https://www.ihu-hepatolyon.fr/les-plateformes-technologiques/

La plateforme intègre un instrument de dernière génération, unique en France le spectromètre de masse timsTOF fleX MALDI-2 de Bruker permettant des analyses d’imagerie MALDI avec une précision inégalée (Financement Région Auvergne-Rhône-Alpes, octobre 2023).


Le spectromètre de masse MALDI-2 est équipé de deux lasers, l’un pour l’ionisation et l’autre pour la post-ionisation, ce qui permet une analyse plus approfondie des échantillons avec une plus grande sensibilité. L’une des caractéristiques de cet instrument est sa capacité à séparer également les isomères en amont de l’analyse grâce à la mobilité ionique – technologie PASEF (lipides, acides biliaires…). Cela permet une résolution supérieure et une identification plus précise des composants biologiques, même dans des échantillons complexes.
De plus, il offre la capacité de réaliser des analyses directement sur des coupes de tissus cryocongelées ou FFPE, permettant ainsi une localisation in situ des composés biologiques (protéines entières, lipides et métabolites) allant de 20 jusqu’à 5 um de résolution spatiale.

Le traitement des données LC-ESI-IM-HRMS et issues de l’imagerie MALDI-IMS, ainsi que leur stockage sont gérées par la plateforme et en étroite collaboration avec la plateforme de chimiométrie et de modélisation – CHEMOD de l’ISA .
Les équipements de la plateforme :
- Cryostat CM3050S (LEICA)
- HTX M3+ sprayer (HTX technologies, LLC)
- HTX SubliMATE (HTX technologies, LLC)
- Microscope à fluorescence DM12000 (LEICA)
- Chromatographie liquide en configuration nano (nanoElute 2)
- Chromatographie liquide en configuration UHPLC (Elute 2)
- Spectromètre de masse timsTOF fleX MALDI-2 avec l’option microgrid (5 um résolution spatiale)



Nos soutiens : La Région Auvergne-Rhône-Alpes, UCBL, CNRS Chimie (Emergence@Int.)
Nos partenaires : AmberGen, Bruker
Collaborations : Toronto General Hospital Research Institute (Toronto Western Hospital Liver Clinic, UHN), St Louis University – Molecular Microbiology and Immunology Faculty, UMR 1350 INSERM PathLiv, UMR 1060 INSERM Laboratoire CarMeN Lyon, Service de chirurgie générale, digestive et transplantations hépatiques et intestinales (HCL Croix-Rousse), Service de chirurgie uro-viscérale, thoracique et de transplantation de l’enfant (HFME)
Pour toute demande de devis, veuillez nous écrire à l’adresse suivante : sophie.ayciriex@univ-lyon1.fr
Contacts :
Sophie Ayciriex (MCU HDR UCBL)
Responsable administrative et scientifique de la plateforme
Justine Massias (IE CDD UCBL)
Responsable technique de la plateforme